Séquençage des gènes EBS

Les chercheurs ont recruté jusqu'à présent 180 personnes atteintes d'EB, soit d'EB simplex, soit d'EB de type inconnu. Ils ont établi un diagnostic génétique pour 104 de ces personnes et, ce faisant, ont identifié 31 changements génétiques différents à l'origine de l'EB, dont 12 n'avaient jamais été signalés auparavant.

Mise à jour vidéo 2024 :

Chercheur principal : Laura Valinotto est chercheuse au Conseil national de recherche scientifique et technique d'Argentine et chercheuse principale au CEDIGEA. Elle est titulaire d'une maîtrise en biotechnologie de l'École de biochimie et de pharmacie de l'Université nationale de Rosario, en Argentine, et a obtenu son doctorat à l'École de biochimie et de pharmacie de l'Université de Buenos Aires, avec ses travaux sur l'épidémiologie moléculaire des infections virales respiratoires pédiatriques au laboratoire de virologie de l'hôpital pour enfants R. Gutiérrez. Pendant qu'elle terminait son doctorat, elle a commencé à faire du bénévolat au département de dermatologie de l'hôpital afin de trouver un moyen de diagnostiquer les patients atteints de génodermatose fréquentant l'hôpital public pour enfants. Après quelques années, elle a été l'une des fondatrices du Centre de recherche sur la génodermatose et l'épidermolyse bulleuse (CEDIGEA), à l'Université de Buenos Aires (UBA). Ici, elle poursuit ses travaux sur le diagnostic moléculaire des génodermatoses, ainsi que sur la recherche moléculaire épidémiologique de la population afin de développer des algorithmes permettant d'effectuer un diagnostic rentable des patients à faible revenu et de créer des dossiers cliniques et moléculaires détaillés de l'EB pour mieux comprendre la pathogenèse de la maladie.

Co-chercheurs : Graciela Manzur est professeure et chef du département de dermatologie de la faculté de médecine de l'université de Buenos Aires. Néonatologiste, pédiatre et dermatologue, elle a travaillé comme dermatologue pédiatrique à l'hôpital pour enfants R. Gutierrez pendant plus de 15 ans, où elle a réussi à ouvrir une nouvelle section de maladies cutanées rares à l'hôpital. Après quelques années, et avec un groupe multidisciplinaire, elle a fondé le CEDIGEA, dont elle est la directrice. Après avoir vu grandir tant d'enfants atteints d'EB, elle a réalisé la nécessité d'un lieu où les patients adultes atteints d'EB pourraient être traités et a lancé un deuxième centre CEDIGEA, pour adultes, à l'hôpital de cliniques de l'université de Buenos Aires.

Dr Mónica Natale est biochimiste et s'occupe du diagnostic moléculaire des génodermatoses à l'hôpital pédiatrique R Gutiérrez. Elle est également l'une des fondatrices du CEDIGEA et est responsable du laboratoire moléculaire, de l'identification de nouveaux cas d'EB et du développement de nouvelles stratégies pour le diagnostic d'autres génodermatoses.

« L’avantage individuel pour chacun de nos patients atteints d’EB est qu’ils pourront bénéficier d’un diagnostic moléculaire qui leur permettra de déterminer le type et le sous-type d’EB et de poser un diagnostic sans équivoque, ce qui est essentiel pour prodiguer les meilleurs soins et conseils génétiques. L’avantage collectif est que les informations recueillies sur la prévalence des variantes peuvent être utiles pour raccourcir l’odyssée diagnostique des futurs patients… et offrir un pronostic plus précis. De plus, dans les populations dont le patrimoine génétique est inexploré, ces études pourraient révéler une diversité de variantes pathogènes jusqu’alors inconnue qui devrait être prise en compte lors de la définition des cibles des thérapies géniques. »

– Docteur Valinotto

Titre de la subvention : Épidémiologie moléculaire de l'épidermolyse bulleuse simplex en Argentine.

L'un des principaux objectifs du Centre de recherche sur les génodermatoses et l'épidermolyse bulleuse (CEDIGEA) en Argentine est de fournir à tous les patients atteints d'EB un diagnostic précis afin de mieux et plus efficacement traiter les symptômes dont ils souffrent, gérer la douleur et fournir le soins interdisciplinaires dont ils ont besoin, quelle que soit leur condition sociale. Notre objectif dans ce projet est de caractériser nos patients cliniquement et moléculairement car il n'y a pas beaucoup de rapports sur l'EB en Amérique du Sud. Au CEDIGEA, nous avons eu l'opportunité de publier une étude similaire avec des patients DEB et Kindler, et notre objectif est de compléter et de publier l'étude des patients EBS.

Notre Centre de Recherche sur les Génodermatoses et l'Épidermolyse Bulleuse (CEDIGEA) de l'Université de Buenos Aires diagnostique et suit les patients sans assurance maladie en Argentine. L'objectif de ce projet est de découvrir la prévalence et la diversité des variantes génétiques associées à l'EBS dans notre population, dont le contexte est inexploré. Être capable de signaler si de nouvelles variantes sont trouvées dans notre région et de créer une base de données pour déterminer si de nouvelles associations phénotypes-génotypes peuvent être déduites est de la plus haute importance. Ce projet de recherche nous permettra en même temps de proposer gratuitement à nos patients à faibles revenus un diagnostic moléculaire définitif.

Avec l'aide de la Faculté de Buenos Aires et les efforts des professionnels du CEDIGEA, nous avons eu l'opportunité de mener à bien un projet antérieur impliquant des patients atteints de DEB, où nous avons diagnostiqué 181 patients de 136 familles non apparentées, trouvant 36 nouvelles variantes et une nouvelle association phénotype-génotype.

Nous avons réalisé des progrès significatifs dans notre projet au Centre de recherche sur la génodermatose et l'épidermolyse bulleuse (CEDIGEA). À ce jour, nous avons recruté 180 patients issus de 121 familles qui nous ont été adressés en raison d'une suspicion clinique d'épidermolyse bulleuse simple (EBS) ou d'une autre épidermolyse bulleuse de type indéfini.

Notre objectif principal était de réaliser des analyses génétiques pour établir des diagnostics moléculaires et en même temps d'en savoir plus sur les bases génétiques de la maladie dans notre population. Jusqu'à présent, nous avons analysé des gènes spécifiques et obtenu un diagnostic moléculaire pour 104 patients, ce qui constitue une avancée considérable. Ce faisant, nous avons identifié 31 variantes pathogènes différentes, dont 12 n'avaient jamais été signalées auparavant dans la littérature.

Cependant, des difficultés sont apparues au cours de notre projet. Nous avons connu des retards dans l'acquisition des réactifs nécessaires au séquençage génétique en raison de l'instabilité économique et de l'évolution de la réglementation dans notre pays, les prix des fournitures de laboratoire étant 300 % plus élevés qu'il y a trois ans. En raison de ces difficultés, nous avons dû revoir notre stratégie pour tirer le meilleur parti de nos fonds de subvention et assurer la réalisation de nos objectifs dans les délais.

En ce qui concerne les publications, nous préparons un manuscrit complet pour présenter nos résultats. Nous pensons qu'en étudiant un si grand nombre de cas, nous serons en mesure de détecter des particularités chez chaque patient et groupes de patients, et ces données seront utiles pour prédire comment la maladie évoluera chez les futurs patients.

En ce qui concerne l'implication des patients, Magdalena et Josefina ont joué un rôle essentiel. Grâce à leur blog « En mi piel », elles ont fourni des informations précieuses et créé une plateforme permettant aux patients de partager leurs expériences. Cette approche centrée sur le patient guide nos recherches et garantit que notre travail répond aux besoins des personnes touchées par l'épidermolyse bulleuse et d'autres maladies cutanées rares.

En résumé, malgré les défis, notre projet progresse bien et nous nous engageons à faire progresser la recherche dans le domaine de l'épidermolyse bulleuse au profit des patients du monde entier.

Et nous ne voulons pas manquer cette occasion de vous inviter au Ve Congrès Argentin de Génodermatoses et d'Épidermolyse Bulleuse, en format virtuel, les 19, 20 et 21 septembre 2024. Pour rester à jour, suivez-nous sur notre Instagram @cedigea.uba

(Extrait du rapport d’étape de mai 2024.)